Части К-3 разделены по отсеку-донору, установленного на месте давно выпиленного по соображениям безопасности реакторного отсека. Они будут воссоединены уже после установки в здание Музея военно-морской славы.
Разделение корпуса лодки производилось прямо на борту погружной баржи «Атлант», на которой сейчас находится К-3 и которая пришвартована в кронштадтском портовом терминале «Моби Дик».
Прочный корпус распилен при помощи алмазных технологий. В работе использована гидравлическая масляная станция мощностью двадцать пять киловатт и специальный алмазный канат, который приспособлен для резки металла. Такой способ резки позволяет обеспечить максимально ровные края, избежать деформации металла от воздействия температуры и изменения его свойств из-за выжигания углерода на кромках.
Чтобы стружка не попадала под канат, в место разреза постоянно подавалась вода. Она же предохраняла канат от перегревания. Плавному протеканию процесса разделения лодки способствовала сама форма прочного корпуса — округлая, без острых углов. К тому же, внутри отсек-донор пуст, поэтому алмазному канату приходилось справляться лишь с металлом прочного корпуса, толщина стенок которого в месте пропила составляет 3 см.